Para poder borrar directorios y subdirectorios en linux lo único que hace falta es realizar este comando
rm -RI
donde -R borra recursivamente directorios que contenga el directorio que queremos borrar y -I borra recursivamente los archivos que contenga ese directorio y sus subdirectorio.
Es decir si tenemos un directorio que se llama “directorio1” que contiene otros directorios “directorio1.1” y otro “directorio1.2” si ejecutas esto
rm -IR
borrará tanto “directorio1” como “directorio1.1” como “directorio1.2” y los archivos que ellos contengan.