Para ver la resolución de un video ejecutamos esto en una consola
ffmpeg -i mi-video.extension
Luego para convertirlo lo que tenemos que hacer es lo siguiente:
ffmpeg -i mi-video.avi (que estaba en 640×480) -s 320×240 (el tamaño al cual lo quiero pasar) mi-video-convertido.mpg
ffmpeg -i mi-video.extension -s 320×240 mi-video-convertido.extension